上記の問題の詳しい設定方法の記述は、次期出荷分(v1.0.1)にて、対応済みです。
具体的な内容は、以下の通りです。
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プログラムで使用するデータ・ストアに対応する“タグ名”を設定します。“タグ名は”JDBCのURLのように、
各データ・ストアの実装・設定をプロパティ・ファイル中で識別する任意の名前となります。

JDBCの場合：
<タグ名>.Implementor=com.ec_one.cBank.cPersistence.PersistenceManagerPSEImpl(1)
<タグ名>.Engine=com.ec_one.cBank.cPersistence.RdbWrapperEngine(2)
<タグ名>.RdbWrapperEngine.Transaction.JTA.Invoke = true(3)
<タグ名>.RdbWrapperEngine.Transaction.JTA.INITIAL_CONTEXT_FACTORY=(4)
<タグ名>.RdbWrapperEngine.Transaction.JTA.PROVIDER_URL＝(5)
<タグ名>.RdbWrapperEngine.Transaction.JTA.USER_TRANSACTION_JNDI_NAME=(5)

(1)(2)JDBCの場合、必ず指定します
(3)UserTransactionを使用する場合、trueを指定します、指定がない場合、falseです。
(4)UserTransactionを使用する場合、JNDI-InitialContextFactoryのクラス名を指定します。
(5)UserTransactionを使用する場合、JNDI-ProviderURLを指定します。
(6)UserTransactionを使用する場合、JNDI-USER_TRANSACTION_NAMEを指定します。

※ (4)(5)(6)については、お使いのアプリケーション・サーバのマニュアルをご覧ください。
 
PSEの場合：
<タグ名>.Implementor = com.ec_one.cBank.cPersistence.PersistenceManagerPSEImpl(1)
<タグ名>.DatbaseName=(2)
<タグ名>.AccessMode = (3)

(1)PSEの場合、必ず指定します。
(2)PSEのデータベースのパスを指定します。
(3)データベースのアクセス・モードを指定します。指定できるモードは、以下のとおりです。
・OPEN_EXCLUSIVE 排他オープン
・OPEN_READ_ONLY リード・オンリー
・OPEN_READ_WRITE リード・ライト（更新）

（設定例）
PSETest.Implementor = com.ec_one.cBank.cPersistence.PersistenceManagerPSEImpl
PSETest.Database.Name = Test.odb
PSETest.Access.Mode = OPEN_READ_WRITE
JDBCTest.Implementor = com.ec_one.cBank.cPersistence.PersistenceManagerJDBCImpl
JDBCTest.Engine = com.ec_one.cBank.cPersistence.RdbWrapperEngine