cPersistenceを使用する為のｃStudioでの設定は、特に必要はありません。
cPersistenceのマニュアルにある記述に沿ってコーディングをしてください。
ただし、作成するアプリケーションで設定ファイルをwarファイル内から読み込む場合
（web.xmlで appl.props.typeにWEB_RESOURCEを指定する場合）は、
cPersistence.propertiesおよびconnection.propertiesを、cStudioのwebパッケージの
ソースファイル出力先のディレクトリに配置してください。
（propsディレクトリ以下のファイルは、ビルド時に自動的にwarファイルに組み込まれます）

また、EJB層でcPersistenceを使用する場合は、"パーシステンス・オブジェクト"
タブからJDBCドライバーURL/テーブル名を指定することによって、テーブルに対応する
モデルクラスを生成する機能がありますので、それを参考にcPersistenceのモデルクラスを
作成することも出来ます。